Les organismes aérobies sont capables de capter une grande fraction de l’énergie libre à partir des substrats respiratoires que les organismes anaérobie. L’essentiel des réactions correspondantes a lieu dans la mitochondrie, qualifiée de ce fait de centrale énergétique de la cellule. La respiration est couplée à la production de l’intermédiaire à haute énergie, l’ATP, par phosphorylation oxydative.